Integrado por expertos de entidades científicas de la Comunitat Valenciana, es el órgano encargado de asesorar y aportar ideas para los contenidos del complejo. 

El Comité de Expertos de la Ciutat de les Arts i les Ciències se reúne periódicamente en el Museu de les Ciències para asesorar y aportar ideas en cuanto a los contenidos del complejo de divulgación científica. Este órgano cumple así con sus tareas de supervisión y asesoramiento sobre temas científicos y de actualidad, mejora de contenidos, nuevas ideas en cuanto a exposiciones y ciclos divulgativos, entre otras propuestas.